Sans les requins, le récif serait un paradis ! Mais Troy, l'ennemi de Pi, et son gang n'attendent que la marée haute pour passer à l'action. Pour se défendre, Pi décide d'entraîner sa famille et ses amis à l'art du "kung-fu sous-marin" quand un poisson inconnu et mystérieux, Ronny, vient les détourner de leur but. Pi aura fort à faire pour sauver le récif et ses habitants.