Dans un future pas si lointain, le monde des humains est contrôlé par un système tout puissant, Fractale, une sorte de Matrice. Ce système permet à l'humanité de vivre dans un monde virtuel en restant simplement connecté au Réseau, voire de se créer une entité virtuelle, un doppel. Mais ce monde à l'apparence idyllique, dont les membres du Temple sont les gardiens, semble être sur le point de s'écrouler. Alors qu'il est perdu dans ses rêveries, Clain, jeune garçon vivant seul avec les doppels de ses parents et fou de technologies rétro, aperçoit un engin volant pourchassé par un autre. Du premier se jette une intrigante jeune fille qu'il tente de secourir.