Soren, petite chouette, coule une enfance paisible dans le sapin creux qu'il occupe avec sa famille, jusqu'à ce qu'il soit enlevé, direction l'orphelinat Saint-Aegolius. Là-bas, avec d'autres oisillons kidnappés, il subit un enseignement des plus étranges mais réussit à se faire rapidement des amis. Ensemble, ils décident de s'enfuir et de rejoindre le grand arbre de Ga'Hoole, un lieu légendaire.