Linnea, une fillette curieuse, accompagnée de son voisin M. Blom, se rendent en France pour découvrir l'oeuvre de Monet et le jardin de Giverny. Linnea dans le jardin de Monet, permet de découvrir Claude Monet et l'impressionnisme à travers le parcours d'une petite fille de la Suède à Paris et Giverny. Le film mêle poétiquement plusieurs techniques : le dessin animé à l'aquarelle pour faire écho à la peinture de Monet, les peintures de Monet, la raison même du film, la photographie, nouvelle technologie de l'époque de Monet et la prise de vue réelle, qui permet notamment d'ancrer le film dans la réalité des jardins de Monet à Giverny.