Deux ans ont passé depuis la destruction de M3GAN. Sa créatrice Gemma, aujourd'hui auteure de renom, milite pour l'encadrement drastique des I.A. par le gouvernement, alors que Cady, sa nièce de 14 ans entre dans l'adolescence et se rebelle contre les règles trop strictes de sa tante. Cependant, à l'insu de tous, la technique de pointe mise au point pour M3GAN a été volée et détournée pour créer une arme militaire connue sous le nom d'AM3LIA.