En rentrant chez elle après une journée d’école, Nonoha est abordée par un étrange jeune homme. Persuadé qu’elle sait où se trouve l’église qu’il recherche, il décide de la suivre et l’agresse alors qu’elle franchit la porte de sa maison. Son assaillant affirme devoir prendre en photo des phénomènes paranormaux relatifs aux légendes urbaines qui circulent sur internet pour atteindre le dernier niveau d’un jeu. S’il y parvient, il pourra peut-être rencontrer sa créatrice, Toa Nakanohi.